Nació el 25 de junio de 1975 en familia campesina que vivía en San Andrés, en el departamento de Santander. Durante su crianza estuvo rodeado por el campo, el ganado y las cosechas de maíz. Desde pequeño soñó con la ciudad y una vida diferente.
Su padre falleció cuando tenía dos años. Estudió en el colegio Concentración de Desarrollo Rural de San Andrés, hasta tercero de bachillerato. Era muy devoto e ingresó al seminario San Alfonso de Piedecuesta, Santander. En el año 2000 se ordenó como sacerdote y se fue a vivir a Bogotá, cumpliendo así sus sueños. Allí trabajó en la localidad de Kennedy en la iglesia San Juan de la Cruz. Rafael fue asesinado junto a su pareja el 26 de enero de 2011.